岩溶所创建于1976年，是自然资源部中国地质调查局直属正局级科研事业单位。主要从事岩溶动力学与全球变化、岩溶生态系统与石漠化治理、岩溶水资源调查评价与开发利用、岩溶塌陷地质灾害防治、岩溶景观与洞穴旅游资源评价、碳酸盐岩油气储层研究等六个业务方向。

内设机构21个，其中综合管理机构8个，技术业务机构11个，挂靠机构1个，其他机构1个。人员编制275名。现有职工217人，其中，正高级职称38人，副高级职称50人；博士50人，硕士131人。 

岩溶所现有2个国际交流合作平台：国际岩溶研究中心，联合国教科文组织框架下第一个地学领域的二类研究中心，同时为国际地质科学联合会附属组织、地球观测组织参与机构；国际标准化组织岩溶技术委员会（ISO/TC 319-karst），全球岩溶领域第一家国际标准化机构，我国地学领域第一家国际标准化机构。现有广西平果喀斯特生态系统国家野外科学观测研究站、岩溶动力系统与全球变化国际联合研究中心等3个国家级科技创新平台，自然资源部/广西岩溶动力学重点实验室、自然资源部岩溶生态系统与石漠化治理重点实验室、自然资源部西南岩溶环境野外科学观测研究站、广西岩溶动力学重大科技创新基地、百色平果喀斯特生态系统广西野外科学观测研究站、广西岩溶资源开发与环境保护工程技术研究中心、广西博士后创新实践基地、中国地质调查局全球气候变化地质研究中心、中国地质调查局岩溶塌陷防治技术创新中心等9个省部级科技创新平台。 

建所以来，完成国家、省部级项目和社会服务项目1000多项，获国家和部局级奖励100多项，出版专著100多部，发表SCI期刊论文500多篇、核心期刊论文1500多篇。